科學文章解析指南:SW的口試準備之路_Day3

大家好,我是SW,相信透過前面的文章,大家對於摘要的拆解有了一定的認識! 提問:在了解文章摘要的結構後,下一步妳會做什麼? Ans: (A)看introduction (B)看Figure 1 ps.沒有對錯,每個人有自己的邏輯 回想當時的情況,我選A,但現在,我選B。 選B的原因是,時間有限,當我看完摘要並拆解,花了2分鐘,剩下的18分鐘我有可能看完整篇paper嗎?我做不到,我想大部分人應該做不到,所以直接看圖的標題、內容以及圖解,是我認為最有效率的方式! 作者對於整篇文章的解讀跟結論都來自於實驗的結果,結果就是圖的呈現,所以看懂圖非常重要,只要看懂圖,甚至不用看內文你也可以抓到作者想表達的結論。 延續上一篇Cell的文章:
圖1 (figure 1): 微生物酵素的甲硫氧化酶催化葡萄糖硫代葡萄糖苷(GSs)轉化為異硫氰酸酯(ITCs) 透過圖一的標題可以知道葡萄糖硫代葡萄糖苷要變成異硫氰酸酯需要來自於微生物的酵素(甲硫氧化酶)幫忙 圖一分成三個小圖A, B and C.
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A和B著重於讓讀者理解化學分子的轉換,A圖是自然情況下會發生的酵素催化作用,B圖則是作者為了利用質譜儀偵測,ITC在medium中會自發性地與Cysteine產生嵌合作用,所以他闡述BITC-Cys的是如何產生。
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C圖來到作者的第一個實驗結果,圖解:在培養液上清液中,由於在富培養基中培養 24 小時的 Bacteroides 菌株產生的BITC共軛物(BITC-cys)濃度。長條圖代表了三個生物重複的平均值 ± 標準差,並在上面疊加了各個重複的個別值。使用液相色譜串聯質譜(LC-MS/MS)的多反應監測(MRM)來追踪質子化的BITC-cys(m/z 271.0)到m/z 122.0的產物離子的轉化過程。 重點來了,C圖該怎麼看?首先這種bar圖要先看懂X和Y軸所代表的意義是什麼。 X軸是作者挑出的各種菌種,利用測定培養液中的ITC含量來定義菌株所表現的酵素活性,也就是Y軸,基本上弄清楚作者的定義,結論就呼之欲出!作者發現腸道菌中的Bt具有催化ITC生成的活性並且根據菌株的不同酵素活性也有所不同。 以上是我今天的分享!請大家一樣幫我按愛心追蹤並留下你們的問題!謝謝大家今天的觀看!根據前一篇同學的回饋,我會盡量講解一些實驗常用的技術來輔助大家對於結果的判讀,祝大家壹切順利。 囉唆幾句: 大家如果想要熟練摘要的拆解,需要透過一些刻意練習,多拿幾篇文章出來看,一定可以優化自己的閱讀跟抓重點的速度,我推薦30篇以上,大約可以縮減將近1/3的時間。
愛心
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