• 賈永婕穿著爭議： 於 2026年10月14日 的立法院備詢中，賴惠員因指點台北101董事長賈永婕的衣著「不夠純樸」而引發網路輿論強烈反彈，隨後賴清德總統亦發圖暗挺賈永婕，賴惠員最終對此致歉。 [1, 2, 3] • 波波牙醫附帶決議： 2022年審查《醫師法》修法時，因涉嫌為在波蘭就讀牙醫的進修女兒量身打造實習綠色通道，被質疑未進行利益迴避。 [1] • 論文抄襲風波： 2023年其國立中正大學碩士論文遭指控抄襲，校方經調查後認定「引注有瑕疵」，要求其限期補正。 [1] • 抹紅同黨同志： 2019年立委補選期間，在節目上指控對手陳筱諭涉嫌「阿扁支持者分裂、受中國操控」，事後遭提告違反選罷法，二審被改判無罪。