安通溫泉的歷史始於明治年間對安通溪一帶的樟腦開發，昭和5年（1930年）設立公共浴場，當時以浴場位於玉里庄而稱為玉里溫泉。戰後公共浴場由玉里鎮公所接手經營，仍稱玉里溫泉公共浴場，直到民國63年（197